Jmol Molecular Visualization 1.1
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Sur Jmol Molecular Visualization
Jmol est un projet de visualisation moléculaire open source (http://jmol.sourceforge.net) très respecté qui implique traditionnellement une application Java autonome ou un applet intégré sur une page Web. Jmol est maintenant disponible sur tablettes Android.
Les utilisateurs de l’activité de visualisation moléculaire Jmol peuvent télécharger et étudier sur leur tablette Android plus de 60 000 structures biomoléculaires directement à partir de la Banque nationale de données protéiques (PDB) par mot clé ou ID PDB et plus de 40 000 000 structures uniques de l’Institut national du cancer des Instituts nationaux de la santé (NIH/NCI) à l’aide d’une grande variété d’identificateurs chimiques, y compris les numéros de registre cas, les clés InChI, les noms commerciaux, les noms communs et les noms de format IUPAC, entre autres. (Pour une liste complète, voir http://cactus.nci.nih.gov/chemical/structure.) Les fichiers de n’importe quel autre site internet qui peut être lu par Jmol peuvent également être chargés.
L’activité de visualisation moléculaire Jmol est une implémentation presque complète à écran tactile de Jmol permettant l’entrée en ligne de commande des commandes Jmol (voir http://chemapps.stolaf.edu/jmol/docs) ainsi qu’une variété de modes de visualisation simples prédéfinits. D’autres rendus incluent une gamme complète de visualisations pour cristaux (cellules unitaires, opérateurs de symétrie, plans Miller, par exemple), une grande variété de surfaces, y compris les surfaces Van der Waals, surfaces accessibles aux solvants, cavités et surfaces moléculaires, et orbitales atomiques et moléculaires.
Les caractéristiques spéciales de la version Android de Jmol incluent une connexion au gyroscope, permettant l’initiation de la filature en déplaçant simplement la tablette d’une manière naturelle (voir http://www.youtube.com/watch?v=JPwvCmD5IDg et http://www.youtube.com/watch?v=D7uOkhoJ0Oc).
Cette activité est en cours de développement actif. Les commentaires sont très appréciés.