Batch ABI/SCF Sequences Assembler est facile à utiliser pour l’assemblage de séquences d’ADN simples et par lots, l’analyse des séquences d’ADN, l’édition contig, l’intégration des métadonnées et la détection de mutations. Il offre également une visionneuse/éditeur de chromatogrammes puissant. L’interface vraiment conviviale fait de Batch ABI/SCF Sequences Assembleur le meilleur choix pour l’assemblage de contig d’ADN. Pourquoi batch ABI/SCF Sequences Assembler est-il spécial ? L’outil d’assemblage des séquences offert par le programme est terminé. Vous pouvez importer et aligner plusieurs séquences d’ADN sur une séquence de référence. Les formats d’entrée pris en charge sont : SCF, ABI, AB, AB1, AB!, FASTA, SEQ, GBK, TXT, multiFASTA. La visionneuse/éditeur de chromatogramme est vraiment bon et facile à utiliser. En un seul clic, n’importe quel chromatogramme peut être complété à l’envers. Les ambiguïtés sont très faciles à repérer dans la visionneuse d’assemblage de séquence parce qu’elles sont clairement marquées en rouge. Il ya des boutons de remorquage qui vous permet de sauter à l’ambiguïté suivante / précédente. Les bases peuvent être modifiées/supprimées. Les extrémités de faible qualité ne sont pas prises en considération lorsque le contig est créé et sont marqués en couleur gris foncé. L’alignement entier peut être vu en un coup d’œil dans la visionneuse de carte contig. http://www.dna-assembly.com
historique de la version
- Version 2.60 posté sur 2012-04-23
Nouveau : Intégration des métadonnées et des métadonnées par lots. Nouveau : Bouton pour ouvrir Windows Explorer dans le dossier contig, après l’assemblage de séquence. Nouveau : Retirez les vecteurs des chromatogrammes simples. Nouveau: SÉQUENCE ANALISYS - marque al bases avec un niveau de confiance (QV) en dessous d’un seuil spécifié, en rouge.
Détails du programme
- Catégorie: Éducation > Science
- Éditeur: DNA Assembly S.R.L.
- Licence: Gratuit
- Prix: N/A
- Version: 2.60
- Plate-forme: windows