FASTA to multi-FASTA converter 2.2
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Sur FASTA to multi-FASTA converter
www.DNABaser.com Cet outil recherchera tous les fichiers FASTA d’ADN dans le dossier spécifié et fusionnera le contenu dans un seul fichier. Le fichier de sortie est automatiquement enregistré sur le disque dur dans le même dossier que les fichiers d’entrée. Autres logiciels par Heracle BioSoft: DNA Baser est une alternative abordable pour l’assemblage de séquences d’ADN et la génération de contigs. Les formats de fichiers pris en charge sont abi, scf et seq (ou FASTA). Les chromatogrammes des séquences assemblées sont affichés dans un format synchronisé avec le contig généré. Des bases ambiguës dans le contig sont mises en évidence et des corrections sont suggérées par DNABaser basées sur les valeurs de qualité des fichiers de traces. Entrée minimale de l’utilisateur requise. L’édition de bases ambiguës, y compris l’insertion et la suppression, est possible. Les réglages du moteur d’assemblage peuvent être ajustés par l’utilisateur. L’utilisateur peut personnaliser l’apparence des chromatogrammes, des nucléotides, de l’arrière-plan. Les valeurs de qualité des fichiers trace s’affichent au-dessus des chromatogrammes, de sorte que l’utilisateur peut facilement décider des corrections dans le contig final. Les fichiers chromatogrammes originaux sont automatiquement coupés en fonction des valeurs de qualité. Le contig est automatiquement enregistré en format FASTA, dans le même répertoire avec les fichiers de traces d’origine. En utilisant une base de données intégrée d’amorce et de séquences vectorielles, qui peut être modifiée/mise à niveau par l’utilisateur, DNABaser peut être configuré pour couper automatiquement la séquence vectorielle de la contig finale. Le prix abordable est une autre caractéristique importante de DNABaser, à seulement 490 USD par licence unique; des rabais importants sont offerts aux institutions qui commandent plusieurs licences de DNABaser (voir notre politique de prix sur nos pages Web).