NDKmol - molecular viewer 0.97
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NDKmol -- Visionneuse moléculaire pour Android == Environ == NDKmol est une visionneuse moléculaire pour Android. Vous pouvez visualiser les structures tridimensionnelles des protéines, des acides nucléiques et des petites molécules. NDKmol prend en charge la plupart des représentations courantes pour les molécules, telles que le ruban, la trace, le bâton, la sphère et la ligne. NDKmol prend également en charge les opérations de symétrie; les assemblages biologiques et l’emballage en cristal peuvent être affichés. Vous pouvez rechercher et télécharger des structures à partir de RCSB PDB et NCBI Pubchem. NDKmol a presque la même fonctionnalité que GLmol, qui est écrit en WebGL/Javascript et fonctionne sur les navigateurs Web. Vous pouvez essayer GLmol à http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Caractéristiques == * Lire le fichier PDB ou SDF/MOL * Rotate/Translate/Zoom modèle par doigt * Représentations - Ligne - Bâton - Sphère (rayon van der Waals) - Trace de carbone Alpha - Ruban (mince ou épais) - Brin - Tube à facteur B - Échelle d’acide nucléique - Ligne d’acide nucléique - solvant 'étoiles' * Lissage des feuilles bêta * Coloriage - Par chaîne - Par structure secondaire (lorsqu’il est défini dans les enregistrements SHEET/HELIX) - Par Éléments - Gradation (alias arc à chaîne) - Facteur B - polaire/non polaire * Cristallographie - Cellule d’unité d’affichage - Afficher l’emballage en cristal (lorsqu’il est défini dans la section REMARQUE) - Afficher l’assemblage biologique (lorsqu’il est défini dans la section REMARQUE) == Comment utiliser == Lorsqu’il est lancé, NDKmol charge automatiquement Porin (PDBID: 2POR) à titre d’exemple. Vous pouvez faire pivoter la molécule par le doigt. Pour zoomer ou traduire la molécule, appuyez sur le bouton MENU de votre téléphone/tablette et sélectionnez le mode. Les gestes à deux doigts sont également pris en charge. Tout le reste peut être fait à partir du MENU. Pour charger d’autres fichiers PDB, veuillez mettre le fichier dans l’annuaire « PDB » de la carte SD et sélectionner la commande « Open » dans le MENU. Vous pouvez également télécharger des structures directement à partir du serveur Web RCSB PDB et NCBI PubChem. Sélectionnez « Recherche et Téléchargement » dans le menu. == Contact == Site Web du projet est situé à http://webglmol.sourceforge.jp/ . Vous pouvez obtenir des codes source pour ce programme à partir d’ici. Les commentaires et suggestions sont les bienvenus http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ ou [email protected] === Avis de licence === NDKmol lui-même est sous licence GNU Lesser General Public License comme suit. Toutefois, les fichiers PDB inclus comme exemples sont dans des conditions différentes. S’il vous plaît consulter http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Visionneuse moléculaire pour Android (C) Droit d’auteur 2011, biochem_fan Ce programme est un logiciel libre : vous pouvez le redistribuer et/ou modifier sous les termes de la licence GNU Lesser General Public, tel que publié par la Free Software Foundation, soit la version 3 de la licence, soit (à votre choix) toute version ultérieure. Ce programme est distribué dans l’espoir qu’il sera utile, mais SANS AUCUNE GARANTIE; sans même la garantie implicite de MARCHANDITÉ OU APTITUDE À UNE FIN PARTICULIÈRE. Voir le GNU Lesser General Public License pour plus de détails. Vous auriez dû recevoir une copie de la licence GNU Lesser General Public