RNA BASER 4.36

Licence: Gratuit ‎Taille du fichier: 1.34 MB
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www.rnaBaser.com Logiciel de gouttière facile à utiliser pour l’assemblage de contigs de séquence d’ARN, l’édition de contig, et la détection de mutation pour Windows. Il s’agit d’un logiciel de biologie moléculaire qui peut visualiser et assembler des séquences en contigs. Caractéristiques : clip final, séquences d’exportation, assemblages, détection de code. Description: RNA Baser est une alternative abordable pour l’assemblage des séquences d’ARN et la génération de contigs. Les formats de fichiers pris en charge sont abi, scf et seq (ou FASTA). Les chromatogrammes des séquences assemblées sont affichés dans un format synchronisé avec le contig généré. Des bases ambiguës dans le contig sont mises en évidence et des corrections sont suggérées par rnaBaser basées sur les valeurs de qualité des fichiers de traces. Entrée minimale de l’utilisateur requise. L’édition de bases ambiguës, y compris l’insertion et la suppression, est possible. Les réglages du moteur d’assemblage peuvent être ajustés par l’utilisateur. L’utilisateur peut personnaliser l’apparence des chromatogrammes, des nucléotides, de l’arrière-plan. Les valeurs de qualité des fichiers trace s’affichent au-dessus des chromatogrammes, de sorte que l’utilisateur peut facilement décider des corrections dans le contig final. Les fichiers chromatogrammes originaux sont automatiquement coupés en fonction des valeurs de qualité. Le contig est automatiquement enregistré en format FASTA, dans le même répertoire avec les fichiers de traces d’origine. En utilisant une base de données intégrée d’amorce et de séquences vectorielles, qui peut être modifiée/mise à niveau par l’utilisateur, rnaBaser peut être configuré pour couper automatiquement la séquence vectorielle de la contig finale. Description : Logiciel de gouttière facile à utiliser pour l’outil de séquençage de l’ARN, l’édition contiguë et la détection de mutations pour Windows. Il s’agit d’un logiciel de biologie moléculaire qui peut visualiser et assembler des séquences en contigs. Caractéristiques : clip final, séquences d’exportation, assemblages, détection de code. C’est une alternative de prix pour l’assemblage de contig d’ARN. Téléchargez des outils freeware pour la conversion de fichiers. trim vector sequence free program align alignment base convert consensus sequencing trace mac os x windows mutation primer, qualité pcr en temps réel.

historique de la version

  • Version 4.36 posté sur 2016-10-20
    Assemblage par lots. Des milliers de contigs peuvent être assemblés à la fois.

Détails du programme