USeq 7.7.7

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Sur USeq

USeq est une collection d’outils logiciels pour l’analyse de bas et de haut niveau de la prochaine génération, les données de séquençage de signature à très haut débit des plates-formes Solexa, SOLiD et 454. Accent initial : chIP-seq et RNA-Seq avec estimations FDR. USeq est en cours de développement continu au Huntsman Cancer Institute dans l’Utah Bioinformatics Shared Resource Center. USeq utilise maintenant le paquet DESeq R pour calculer les valeurs p à partir d’une distribution binomiale négative pour l’enrichissement différentiel/ réduction.