USeq est une collection d’outils logiciels pour l’analyse de bas et de haut niveau de la prochaine génération, les données de séquençage de signature à très haut débit des plates-formes Solexa, SOLiD et 454. Accent initial : chIP-seq et RNA-Seq avec estimations FDR. USeq est en cours de développement continu au Huntsman Cancer Institute dans l’Utah Bioinformatics Shared Resource Center. USeq utilise maintenant le paquet DESeq R pour calculer les valeurs p à partir d’une distribution binomiale négative pour l’enrichissement différentiel/ réduction.
historique de la version
- Version 7.7.7 posté sur 2011-04-01
Plusieurs correctifs et mises à jour - Version 7.7.7 posté sur 2011-04-01